Escriu per cercar…

Eines computacionals en bioinformàtica

Programar fent servir les dades biològiques i genòmiques com a domini: anàlisi, emmagatzematge i seqüències, sempre amb codi propi.

Enfocament

Aquest mòdul forma part d’un cicle de desenvolupament d’aplicacions web, i s’avalua per allò que saps programar.

La biologia hi és perquè és el domini del perfil i perquè dona problemes de debò: un conjunt de dades clíniques, un genoma, un alineament de seqüències. El que en surt, però, és competència de programació — llegir dades, escriure funcions, dibuixar allò que has calculat i comprovar que el resultat s’aguanta.

Per això cada concepte de la teoria acaba en codi que l’executa, i no en una imatge que te’l descriu.

DAW-BIOC044110 h2n curs4 activitats41 pàgines4 resultats d'aprenentatge
1Anàlisi de dades35 h2Gestió de dades25 h3ADN20 h4Anàlisi de seqüències30 h

Programa

Resultats d'aprenentatge

RA1Identifica les fonts de dades en informàtica mèdica, reconeixent la importància del tractament de les dades en l’obtenció d’informació fiable.A15 criteris d'avaluació
  1. CA1Identifica l’origen de les dades utilitzades en informàtica mèdica.
  2. CA2Reconeix la necessitat d’anonimitzar les dades per a la utilització en informàtica mèdica.
  3. CA3Identifica els diferents tipus de dades biomèdiques.
  4. CA4Valora la importància del tractament estadístic de les dades per obtenir resultats significants.
  5. CA5Reconeix l’estructura i utilitza l’entorn de programari R.
RA2Consulta, modifica i gestiona la informació emmagatzemada en bases de dades mèdiques, emprant els procediments, funcions i guions incorporats en el llenguatge de manipulació de dades.A26 criteris d'avaluació
  1. CA1Utilitza serveis desenvolupats amb la tecnologia de la informàtica en el núvol o cloud computing.
  2. CA2Identifica les funcions i les ordres bàsiques per a treballar amb les bases de dades mèdiques.
  3. CA3Realitza consultes en les bases de dades utilitzant els procediments adequats en cada cas.
  4. CA4Defineix guions per automatitzar tasques de recerca d’informació en la base de dades.
  5. CA5Utilitza adequadament les eines i aplicacions d’ús habitual en informàtica mèdica.
  6. CA6Elabora informes relacionats amb les dades obtingudes a partir de les eines utilitzades.
RA3Identifica les principals biomolècules i els àmbits d’aplicació en el sector biomèdic i agroalimentari, reconeixent la importància de les ciències òmiques en el context de la recerca biomèdica i agroalimentària.A36 criteris d'avaluació
  1. CA1Identifica l’estructura i les propietats de les proteïnes.
  2. CA2Identifica l’estructura i les propietats dels àcids nucleics.
  3. CA3Descriu els processos de transcripció i de síntesis de proteïnes.
  4. CA4Reconeix les tècniques de seqüenciació de l’ADN
  5. CA5Diferencia i relaciona entre elles les ciències òmiques.
  6. CA6Identifica els principals sectors d’aplicació en l’àmbit biomèdic i agroalimentari.
RA4Consulta, modifica i gestiona la informació emmagatzemada en bases de dades bioinformàtiques, emprant els procediments, funcions i guions incorporats en el llenguatge de manipulació de dades.A45 criteris d'avaluació
  1. CA1Identifica les funcions i les ordres bàsiques per a treballar amb les bases de dades bioinformàtiques.
  2. CA2Realitza consultes en les bases de dades utilitzant els procediments adequats en cada cas.
  3. CA3Defineix guions per automatitzar tasques de recerca d’informació en la base de dades.
  4. CA4Utilitza adequadament les eines i aplicacions d’ús habitual en ciències òmiques.
  5. CA5Elabora informes relacionats amb les dades obtingudes a partir de les eines bioinformàtiques utilitzades.