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Herramientas computacionales en bioinformática

Programar usando los datos biológicos y genómicos como dominio: análisis, almacenamiento y secuencias, siempre con código propio.

Enfoque

Este módulo forma parte de un ciclo de desarrollo de aplicaciones web, y se evalúa por lo que sabes programar.

La biología está porque es el dominio del perfil y porque da problemas de verdad: un conjunto de datos clínicos, un genoma, un alineamiento de secuencias. Lo que sale de ahí, sin embargo, es competencia de programación — leer datos, escribir funciones, dibujar lo que has calculado y comprobar que el resultado se sostiene.

Por eso cada concepto de la teoría acaba en código que lo ejecuta, y no en una imagen que te lo describe.

DAW-BIOC044110 h2n curs4 actividades41 páginas4 resultados de aprendizaje
1Análisis de datos35 h2Gestión de datos25 h3ADN20 h4Análisis de secuencias30 h

Programa

Resultados de aprendizaje

RA1Identifica las fuentes de datos en informática médica, reconociendo la importancia del tratamiento de los datos en la obtención de información fiable.A15 criterios de evaluación
  1. CA1Identifica el origen de los datos utilizados en informática médica.
  2. CA2Reconoce la necesidad de anonimizar los datos para su uso en informática médica.
  3. CA3Identifica los diferentes tipos de datos biomédicos.
  4. CA4Valora la importancia del tratamiento estadístico de los datos para obtener resultados significativos.
  5. CA5Reconoce la estructura y utiliza el entorno de software R.
RA2Consulta, modifica y gestiona la información almacenada en bases de datos médicas, empleando los procedimientos, funciones y scripts incorporados en el lenguaje de manipulación de datos.A26 criterios de evaluación
  1. CA1Utiliza servicios desarrollados con la tecnología de la informática en la nube o cloud computing.
  2. CA2Identifica las funciones y las órdenes básicas para trabajar con las bases de datos médicas.
  3. CA3Realiza consultas en las bases de datos utilizando los procedimientos adecuados en cada caso.
  4. CA4Define scripts para automatizar tareas de búsqueda de información en la base de datos.
  5. CA5Utiliza adecuadamente las herramientas y aplicaciones de uso habitual en informática médica.
  6. CA6Elabora informes relacionados con los datos obtenidos a partir de las herramientas utilizadas.
RA3Identifica las principales biomoléculas y los ámbitos de aplicación en el sector biomédico y agroalimentario, reconociendo la importancia de las ciencias ómicas en el contexto de la investigación biomédica y agroalimentaria.A36 criterios de evaluación
  1. CA1Identifica la estructura y las propiedades de las proteínas.
  2. CA2Identifica la estructura y las propiedades de los ácidos nucleicos.
  3. CA3Describe los procesos de transcripción y de síntesis de proteínas.
  4. CA4Reconoce las técnicas de secuenciación del ADN.
  5. CA5Diferencia y relaciona entre sí las ciencias ómicas.
  6. CA6Identifica los principales sectores de aplicación en el ámbito biomédico y agroalimentario.
RA4Consulta, modifica y gestiona la información almacenada en bases de datos bioinformáticas, empleando los procedimientos, funciones y scripts incorporados en el lenguaje de manipulación de datos.A45 criterios de evaluación
  1. CA1Identifica las funciones y las órdenes básicas para trabajar con las bases de datos bioinformáticas.
  2. CA2Realiza consultas en las bases de datos utilizando los procedimientos adecuados en cada caso.
  3. CA3Define scripts para automatizar tareas de búsqueda de información en la base de datos.
  4. CA4Utiliza adecuadamente las herramientas y aplicaciones de uso habitual en ciencias ómicas.
  5. CA5Elabora informes relacionados con los datos obtenidos a partir de las herramientas bioinformáticas utilizadas.